三年前的那場事故，使得涼宮遙以及鳴海孝之的人生發(fā)生了巨大的變化。遙昏睡了整整三年，即使是蘇醒后的短時間內(nèi)記憶也一直是處在混亂狀態(tài)。孝之因為遙的事故而深受打擊，過著茫然自失的生活。但是全靠了速瀨水月獻身性的努力，雖然幾經(jīng)周折但還是振作了起來。隨后在遙出院的當天，孝之以及好朋友平慎二、遙的父親宗一郎以及遙的妹妹茜一起，前往醫(yī)院迎接出院了的遙。但是在那里，并沒有出現(xiàn)一直支撐著孝之的水月的身影……