終于當上了“神龍大俠”的熊貓阿寶可謂過上了夢想中的日子，他和師傅以及蓋世五俠——虎、鶴、螳螂、蛇和猴子——保衛著山谷中寧靜的生活。但是，好時光不長，阿寶面臨著一次新的、更加可怕的挑戰，一個大惡人孔雀“Lord Shen”擁有了一件秘密、強悍的武器，他妄圖毀滅功夫、征服中國！ 此時，正是阿寶與蓋世五俠穿越中國，正式迎接挑戰的時候了，但是，阿寶將怎樣對抗一個能“毀滅功夫”的武器？他必須回顧他的過去，并且揭開自己身世之謎，只有到那時，他才能釋放體內的力量、從而獲得勝利。